Флоры сосудистых растений области достаточно изучены, что дает возможность оценить природоохранную значимость заповедника и закзника в региональном флористическом аспекте. Видовое богатство области распределено по отделам флоры следующим образом:
Плаунообразные – 5, 5, 5; Хвощеобразные – 6, 6,10; Папоротниковообразные – 14, 16,18; Голосеменные – 5, 7, 7; Покрытосеменные – 741, 875, 1360 видов соответственно.
Плаунообразные представлены во флоре заказника и прилегающей территории полно - 100% видового богатства отдела в области. Это баранец обыкновенный, плауны булавовидный, годичный, сплюснутый и топяной. Хвощеобразные представлены недостаточно полно - 60 % видового богатства в области. Это хвощ болотный, ветвистый, зимующий, лесной, луговой, полевой и приречный. Во флоре заказника отсутствуют крайне редкие и возможно уже исчезнувшие в области виды. Это хвощ камышовый, большой и пестрый. Папоротникообразные представлены достаточно полно (78 % и 83 % соответственно). Здесь произрастают голокучник обыкновенный, кочедыжник женский, орляк обыкновенный, гроздовники виргинский, многораздельный и полулунный, страусник обыкновенный, ужовник обыкновенный, щитовники гребенчатый, Картузиуса, мужской и распростертый, фегоптерис связывающий, телиптерис болотный. Голосеменные представлены полно – 3 вида исчерпывают местную флору хвойных. Это сосна обыкновенная, ель обыкновенная и можжевельник обыкновенный. Остальные виды – интродуценты. Покрытосеменные представлены полно – 54% видового богатства отдела в области. Для флоры заповедника характерны в основном лесные, болотные и луговые виды. Отсутствуют лесостепные, многие сухолуговые и ряд водных видов растений, а также большинство адвентивных видов, характерных для антропогенных местообитаний. Обширный отдел покрытосеменных растений характеризует спектр наиболее богатых видами семейств. Для флоры территории: сложноцветные – 87, мятликовые (злаки) – 68, осоковые – 49, розоцветные – 40; гвоздичные -35; бобовые – 34, крестоцветные – 24, губоцветные – 32, норичниковые – 27, зонтичные – 23, лютиковые – 22; орхидные – 19; гречишные – 19, лилейные – 16, ивовые - 16 видов. В ботанико-географическом плане флора этих мест типична для зоны широколиственных лесов Восточной Европы. Преобладают виды с широкими ареалами. Собственно бореальные виды - редки и малочисленны. Среди них гудайерая ползучая, линнея северная, ива лапландская, мирт болотный, осока шаровидная и др. Тоже самое относится и к типично неморальным видам, характерным для широколиственных лесов Западной Европы. В их числе лук медвежий, зубянка луковичная, осока трясунковидная, хохлатка полая и др.